物流運輸管理系統需要從系統的角度解決物流軟件體系的問題，我們引用系統論的觀點： 系統論的核心思想是系統的整體觀念。任何系統都是一個有機的整體，它不是各個部分的機械組合或簡單相加，系統的整體功能是各要素在孤立狀態下所沒有的性質。系統中各要素不是孤立地存在著，每個要素在系統中都處于一定的位置上，起著特定的作用。要素之間相互關聯，構成了一個不可分割的整體。
三方物流運輸管理系統與配送實現的是貨物的空間轉移，倉儲體現的是貨物的時間價值，再加上裝卸、搬運、流通加工、包裝等物流軟件的要素，組合成了幾乎所有的物流軟件活動。
